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Más o menos
un año después, se lanzó
al mercado el Sinclair ZX81 y convencí
a mis padres para que me compraran este
aparato maravilloso de 1K RAM, sin disco
duro, con 8K ROM. En nuestro club informático
del barrio, mis amigos y yo logramos domar
estas pequeñas maquinas. Los conocimientos
que adquirí en aquella época
me han servido mucho desde entonces, primero
como biólogo, y luego como Director
de Bioinformática con CuraGen
corp.
¿Cómo fui capaz de ir ascendiendo
hasta lograr el cargo de 'Director'? Estudié
la carrera de Ciencias celulares y moleculares,
lo que más que nada resultó
ser un nombre elegante para decir Bioquímica.
Curiosamente, la estadística era
una asignatura obligatoria durante dos
de los tres años que duró
la carrera. Así que tuve el placer
de afrontar mi inteligencia contra un
ordenador VAX que tenía el programa
de estadística llamado Minitab.
Afortunadamente, le gané la partida
al VAX, me licencié, y empecé
a trabajar como técnico para el
gobierno británico, donde mi trabajo
consistía en perseguir el equivalente
en los seres humanos de la enfermedad
de las vacas locas. Mis conocimientos
de la informática me permitieron
efectuar los análisis del laboratorio
sobre las consecuencias de las secuencias
del gen PRION, conectándome vía
telnet con el servidor del Massachusset
Institute of Technology (MIT), que
tenía un programa PARA el análisis
de secuencias genéticas llamado
Genetics Computer Group (GCG).
Estos conocimientos me acompañaron
cuando me mudé a Boston en 1999
para empezar mis estudios de doctorado
en Farmacología molecular.
Descubrí con asombro hasta qué
punto estaban cableadas las universidades
norteamericanas y no pude resistirme ante
las tentaciones que ofrecía el
mundo de Internet. Pronto me convertí
en uno de los principales protagonistas
del grupo de noticias BioNet, donde me
dediqué a la sección sobre
los Métodos
y Reagents. En 1994, leí
un anuncio en una de las listas de correo
virtuales sobre un nuevo entorno virtual
denominado BioMOO.
Un joven estudiante del Instituto
Weizmann había creado un mundo
virtual e invitaba a otros a participar
con telnet. Pronto hice el login, y construí
mi propio pequeño imperio, incluyendo
un puerto para el programa Mailfasta utilizado
en los análisis de secuencias por
correo electrónico. Este fue el
primer proyecto de programación
en el que logré combinar mis conocimientos
de biología, de análisis
de secuencias y de ordenadores. Al poco
tiempo de afiliarme a BioMOO, la red empezó
a salpicarnos a todos, produciendo todo
tipo de nuevas oportunidades para investigar.
Armado con herramientas para construir
una página web, me propuse el objetivo
de atraer visitantes a un sitio web propio.
Con esta idea, creé un registro
de empresas biotécnicas (Biotech
Company Register - BCR), una página
donde se registraban vendedores en el
campo de las llamadas Life Sciences
(un término norteamericano para
las ciencias de medicina, biología,
zoología, química, bioquímica,
genética etc.) y empresas biotécnicas
y farmacéuticas. Gestionaba la
página Web en mi laboratorio de
la Universidad de Boston, utilizando un
Mac Classic II como servidor.
BCR tuvo tanto éxito que, siendo
todavía estudiante de doctorado,
decidí venderlo. Era el año
1995. Pero eso me creó un problema
- ¿cómo iba a conseguir
que ojos interesados viesen mi currículum
vitae si no tenía mi propia página
web? La respuesta era obvia: ¡tendría
que crear otra! Entonces, aprovechando
mis numerosos contactos en el campo de
las life sciences, y el sector de diagnósticos
y biotecnología, creé un
nuevo sitio web llamado "Biotech
Rumor Mill" (o en español:
"el molino de los rumores sobre biotecnología"),
un sitio único que permitía
la publicación anónima de
todo tipo de cotilleos y rumores relacionado
con el campo. Pronto el número
de usuarios empezó a crecer.
En pocos meses accedí a un proveedor
de servicios de Internet (ISP). Y una
vez instalado mi servidor en un ordenador
"de verdad" de Sun, decidí
comprar un libro sobre cómo aprender
el lenguaje informático Perl en
30 días. Bueno, fueron necesarios
6 meses hasta que dominé los primeros
10 días del libro, y solo lo logré
con la ayuda de los conocidos libros de
Llama y Camel sobre Perl (llamados así
por las imágenes de una llama y
un camello que aparecen en la portada
de sus libros). No obstante, aprender
Perl mereció el esfuerzo. De hecho
supuso la clave para mi gran oportunidad
y mi transformación de biólogo
a bioinformático.
Una noche, Jonathan Rothberg, empresario
y presidente y consejero delegado de CuraGen
Corp, navegó hacia mí y
nos pusimos en contacto. Él estaba
creando un grupo de bioinformática
en CuraGen y le hacían falta biólogos.
¡Había llegado mi oportunidad!
Mientras acababa mi Doctorado, trabajé
como consultor para CuraGen. Doce meses
más tarde, en 1997, me doctoré,
y CuraGen me contrató como investigador,
uno de los pocos biólogos contratados
para el grupo de bioinformática.
Mi primer proyecto era acabar el programa
de análisis de secuencia CuraTools
que había ya empezado cuando trabajaba
con ellos desde la Universidad como consultor.
Desde el principio, mi éxito se
debe a los fuertes vínculos formados
con científicos (que descubren
cosas) y la estrecha colaboración
con ellos que nos ha permitido resolver
problemas utilizando programas sencillos
que ayudan a automatizar sus tareas de
descubrimiento. He seguido esta estrategia
durante los últimos 3 años
y, en la actualidad, dirijo el grupo de
bioinformática de CuraGen dedicado
a la espersión genética,
el análisis de secuencias, el desarrollo
de medicamentos y el apoyo a la bioinformática.
Algunos consejos
para posibles bioinformáticos:
- Aprender el uso
básico de Perl, HTML y bases
de datos relacionadas (yo todavía
tengo para dominar este último).
- Si acaba de hacer
un Master en bioinformática o
informática, realice algunos
proyectos personales de programación.
Esto supondrá una ventaja cuando
mande una solicitud para un puesto en
el sector de la bioinformática.
- Descargue bases
de datos y software del National Center
for Biotechnology Information y familiarícese
con el análisis de secuencias,
el análisis de expresión
y otras formas de manipulación
de datos genómicos.
- Intente
trabajar para una pequeña empresa
si sus conocimientos sobre programación
son limitados. Por necesidad, sus limitaciones
se pasarán por alto.
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